Dzisiejszy kościół św. Jana Chrzciciela w Pniewach wzniesiono w XIX w. na potrzeby gminy ewangelickiej. Po II wojnie światowej, gdy w Pniewach nie było już Niemców, zabytek z polecenia władz komunistycznych został przeznaczony na magazyny "Gminnej Spółdzielni" w Pniewach. Zwrócono go Kościołowi rzymskokatolickiemu dopiero w latach 80.