Szkoła podstawowa znajduje się naprzeciwko kościoła pw. świętych Piotra i Pawła. Została zbudowana przez mieszkańców wioski przed I wojną światową. Miało to miejsce w czasie kiedy wieś Łapsze Wyżne należały do monarchii austro-węgierskiej. Obiekt został wzniesiony z cegły wypalanej przez mieszkańców. Obecnie szkoła ta jest najstarszą szkołą na Spiszu.
W 2011 roku w 100 lecie szkoły, szkoła otrzymała imię błogosławionego Jana Pawła II. Wydarzenie to upamiętnia tablica pamiątkowa wmurowana obok wejścia do szkoły. Poniżej tablicy umieszczona jest informacja o jej fundatorach o treści: "TABLICĘ PAMIĄTKOWĄ UFUNDOWAŁA POLONIA – NEW JERSEY-USA 07.06.2011 r."