Pierwszy drewniany kościół w Pawłowicach wybudowano na przełomie XIII i XIV wieku. W 1594 r., dzięki staraniom ówczesnego biskupa ołomunieckiego Stanisława Pawłowskiego przystąpiono do budowy okazałego, murowanego kościoła. Budowę zakończono w 1596 r., a dotychczasową drewnianą świątynię rozebrano w 1611 r. i przeniesiono do Golasowic (spłonęła w 1974 r.).
Kościół pw. św. Jana Chrzciciela w Pawłowicach w marcu 1945 r. został kompletnie zniszczony przez wycofujący się oddział niemiecki. Pozostało jedynie prezbiterium z XVI wieczną polichromią przedstawiającą fundatorów, księcia cieszyńskiego Adama Wacława i biskupa Stanisława Pawłowskiego. Podczas wysadzania przez Niemców wieży kompletnemu zniszczeniu uległy znajdujące się tam dzwony.
Bezpośrednio po wojnie kościół został odbudowany, ale nie wystarczyło środków na wybudowanie wieży, więc odlane na nowo dzwony zawieszono na prowizorycznej konstrukcji za ogrodzeniem. W 1993 r. dobudowano wieżę i na powrót powieszono w niej dzwony. Przed wejściem na plac kościelny znajduje się krzyż z 1871r.